Valor pronóstico y patrones de coexpresión de vías metabólicas en cánceres

Dan Zhang, Yan Guo y Ni Xie | 29 de diciembre de 2020
Antecedentes: Las vías metabólicas anormales se han considerado como uno de los sellos distintivos del cáncer. Mientras
Se han estudiado numerosas vías metabólicas en varios tipos de cáncer, el vínculo directo entre la vía metabólica
No se ha establecido la expresión génica y el pronóstico del cáncer.
Resultados: Utilizando dos métodos de análisis bioinformáticos desarrollados recientemente, evaluamos el potencial pronóstico de
expresión de vías metabólicas y desregulaciones tumorales versus normales para hasta 29 vías metabólicas en 33 cánceres
tipos Los resultados muestran que el aumento de la expresión génica metabólica dentro de los tumores se corresponde con un mal pronóstico del cáncer.
El análisis de coexpresión metadiferencial identificó cuatro vías metabólicas con una coexpresión global significativa
perturbación de la red entre el tumor y las muestras normales. Análisis de expresión diferencial de vías metabólicas
también demostraron una fuerte alteración de la expresión génica entre muestras normales y tumorales emparejadas.
Conclusión: Tomados en conjunto, estos resultados sugirieron fuertemente que las expresiones génicas de la ruta metabólica son
perturbado después de la tumorigénesis. Dentro de los tumores, muchas vías metabólicas se regulan al alza para que las células tumorales se activen.
metabolismos correspondientes para mantener la energía necesaria para la división celular.
Palabras clave: vía metabólica, análisis de coexpresión meta, puntuación compuesta de expresión génica, cáncer

La autocigosidad global se asocia con el riesgo de cáncer, la firma mutacional y el pronóstico

Limin Jiang, Fei Guo, Jijun Tang, Shuguan Leng, Scott Ness, Fei Ye, Huining Kang, David C. Samuels y Yan Guo | 04 de diciembre de 2020
La autocigosidad global en forma de corridas de homocigosidad está asociada con varias enfermedades. La proporción de heterocigosidad, una medida alternativa de autocigosidad global, se usa para evaluar el riesgo de cáncer en este estudio. Nuestro análisis muestra asociaciones fuertes y consistentes entre las proporciones de heterocigosidad y varios tipos de cáncer. Un análisis más detallado revela las posibles conexiones de la proporción de heterocigosidad con las firmas mutacionales y el pronóstico del cáncer.