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Por Michael Haederle

Arrojando luz sobre el genoma oscuro

Las proteínas recientemente descritas conducen a nuevas y prometedoras terapias farmacológicas

En biología de la escuela secundaria nos enseñaron que miles de proteínas diferentes dan forma a las células de nuestra piel, músculos, nervios, órganos y tejido conectivo. Cada proteína se construye a partir de una cadena de aminoácidos de acuerdo con una plantilla codificada en nuestro ADN: el genoma.

Si bien los científicos han registrado con éxito la mayoría de los aproximadamente tres mil millones de "letras" en el genoma humano, no han desentrañado por completo el "proteoma", el conjunto correspondiente de proteínas en el cuerpo. De hecho, casi una de cada tres de nuestras proteínas no se ha caracterizado en detalle, y más de 6,000 proteínas codificadas por este genoma "oscuro" permanecen en gran parte sin estudiar.

La búsqueda para comprender mejor el genoma oscuro, y quizás descubrir nuevos tratamientos para la enfermedad, ha sido durante mucho tiempo una pasión impulsora para Tudor Oprea, MD, PhD, profesor y jefe de la División de Informática Traslacional en el Departamento de Medicina Interna de la Universidad de Nuevo México.

"Sólo unas 3,000 proteínas humanas están bien estudiadas y bien comprendidas", dice Oprea. "Piénselo: nuestros libros de texto de farmacología y bioquímica cubren alrededor del 15 por ciento del proteoma humano. Se necesita mucho más trabajo para completar el resto del rompecabezas".

Oprea es un investigador líder en el proyecto Illuminating the Druggable Genome (IDG), financiado por los Institutos Nacionales de Salud. Incluye investigadores estadounidenses de la Universidad de California, Davis, la Universidad de California, San Francisco, la Universidad de Carolina del Norte en Chapel Hill, la Universidad de Washington en St. Louis, la Escuela de Medicina Icahn en Mount Sinai, la Universidad de Miami y Massachusetts General. Hospital, así como colaboradores en Inglaterra, Dinamarca, Rumanía e India.

En los primeros dos meses de este año, Oprea recibió una continuación de $ 1 millón de su subvención de varios años para el IDG Knowledge Management Center, y también compartirá un nuevo premio de $ 588,000 con un colega en The Jackson Laboratory en Bar Harbor, Maine.

Oprea y Larry Sklar, PhD, profesor distinguido en el Departamento de Patología de la UNM, Maralyn S. Budke y Robert E. Anderson Distinguished Endowed Chair in Cancer Drug Discovery y director del UNM Center for Molecular Discovery, también se asocian con un colega de la Universidad de la Escuela de Medicina de Miami en el Centro de Difusión y Difusión de Recursos del IDG.

El año pasado, el IDG Knowledge Management Center de Oprea propuso un elegante esquema de cuatro partes para categorizar el genoma de acuerdo con el grado de estudio de los genes y las proteínas que codifican.

Hasta ahora, el déficit de conocimiento ha tendido a perpetuarse a sí mismo, porque es más probable que los científicos reciban fondos para estudiar aquellas áreas del genoma que ya están relativamente bien descritas, un poco como el hombre borracho que busca sus llaves bajo la farola porque ahí es donde está la luz.

A través del consorcio IDG, los NIH están liderando el esfuerzo global para guiar a los científicos hacia la exploración de proteínas poco estudiadas, algunas de las cuales seguramente serán objetivos prometedores para nuevas terapias con medicamentos.

De hecho, 2018 fue un año excepcional para agregar nuevas piezas al rompecabezas: un récord de 14 nuevos objetivos de medicamentos ingresaron al mercado a medida que se aprobaron nuevos medicamentos en los EE. UU., Europa y Japón. Y por el momento, el IDG tiene 400 piezas de rompecabezas "oscuras" adicionales en su punto de mira, y se esperan más avances pronto.

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